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霉菌储粮水分的高低是霉菌生长的重要决定因素，也是粮食储藏过程中发生霉变的主要原因。粮食入库时需严格控制含水量，粮库密闭门窗，晒干入库，种子的含水量不宜超过15%；在仓库内放置无水氯化钙、草木灰等降低空气湿度，将相对湿度降低到60%以下；粮仓等设备建好防潮地坪和防潮墙以隔离湿气。此外，混在粮食中的各种杂质、破损粒和不成熟粒等往往携带大量的微生物，一般1g粮食含微生物4000多个，粮库密闭门窗厂家，而1g杂质含微生物高达50000多个。新粮入仓前利用风车和清理筛等清除混在粮食中的各种杂质，保持粮食清洁卫生和粮粒完整。粮食入仓前利用乙醇、次氯酸钙、次、二氧化氯和氧化氢等消毒剂对仓储设施进行消毒处理，杀灭霉菌。

气调储藏技术为了解决化学药熏蒸所造成的问题，气调技术作为一种环保，安全，有效的储藏方式逐渐代替了等化学药熏蒸法，它有不使用化学药就可达到灭虫防霉，减缓粮食品质劣变和避免环境污染、害虫抗药性产生等优点。充氮气在对充氮气调储藏和常规储存的玉米品质进行了比较研究，结果显示，粮库密闭门窗生产厂家，低温时，两种方式储藏的玉米品质无明显差异，在20℃储藏6个月，玉米发芽率由96％分别降低至87％、85％，脂肪酸值由22.4（KOH／干基）／（mg／100g）分别增长至45.9（KOH／干基）／（ｍｇ／100g）、47.4（KOH／干基）／（mg／100g）；在高温35℃储藏６个月，粮库密闭门窗价格，玉米的发芽率分别降低至42％、8％，脂肪酸值分别增长至49.5（KOH／干基）／（mg／100g）、57.6（KOH／干基）／（mg／100g），充氮气调储存的玉米品质指标变化程度都要比常规储藏小，气调储藏利于玉米储藏。

但是，过度依靠化学药杀虫防霉也引起了许多问题，如人畜累积毒、环境和粮食污染及害虫抗药性逐渐加强。有调查显示我国40个粮库所采集的米象、谷蠹、玉米象、锯谷盗、赤拟谷盗和锈赤扁谷盗等６个品系的77个虫样，其中抗性虫样约占62％，主要集中在河北、湖北、四川和广东等地。对于害虫抗性的形成，研究者提出了许多理论，如基学说、变学说等，但大都认为多次使用同种药剂会强化害虫对药剂的适应性。目前，因具有良好的扩散性、杀虫效果好、操作简单、成本低的优势，我国约90％的粮库采用磷氢熏蒸防治储粮害虫，其有的地位。